进行在体动物实验时，宜用清醒状态的动物，这样将更接近生理状态，有的实验则必须用清醒动物。但在进行各类动物实验时，各种强刺激（疼痛）持续地传入大脑皮质，会引起大脑皮质的抑制，使其对皮质下中枢的调节作用减弱或消失，致使机体生理机能发生障碍，甚至发生休克及死亡。另一方面，许多实验动物性情凶暴，容易伤及操作者。因此，动物实验时，动物的麻醉是必不可少的。

实验动物的麻醉就是用物理的或化学的方法，使动物全身或局部暂时痛觉消失或痛觉迟钝，以利于进行实验。

动物的麻醉与人类的麻醉有不同之处，特别是麻醉毒性、副作用、使用剂量等方面是与人类有差别的，不能完全通用。

动物麻醉的方法有全身麻醉、局部麻醉、针刺麻醉、复合麻醉、低温麻醉等。一般实验室所采用的大部分是全身麻醉和局部麻醉。

麻醉药的种类较多，作用原理也各有不同，它们除能抑制中枢神经系统外还可引起其他一些生理机能的变化。所以需根据动物的种类和实验手术的要求加以选择。麻醉必须适度，过浅或过深都会影响手术或实验的进程和结果。