品种(stock)是种以下的进一步的分类。品种一般系指具有一些容易识别和人们所需要的性状，而且可以基本稳定遗传的动物群体。如青紫蓝兔、Wistar大鼠、KM小鼠等。

品系(strain) 是指在实验动物学中把基因高度纯合的动物称作品系动物。如，C57BL/6是近交系动物中的一个品系，属低癌、高补体活性的动物。

习惯上把近交系动物称为品系，封闭群动物称为品种。实验动物按遗传学特征分类：

1.近交系  近交系一般是指采用20代以上全同胞兄弟妹妹或亲子（子女与年青的父母）进行交配，而培养出来的遗传基因纯化的品系。因全同胞兄弟妹妹交配较为方便而多被采用。如以杂种亲本作为基代开始用用上述近交方式，至少要连续繁殖二十代才初步育成近交系。因到此时基本接近纯化，品系内个体间差异很小。－般用近交系数（F）代表纯化程度，全同胞兄弟姊妹近交一代可使异质基因（杂合度）减少19%，即可使纯化程度增加19%。全同胞兄妹或亲子交配前二十代纯合度的理论值可达F＝98.6%，然而纯与不纯仅从近交系数来说明并不足为凭。还要用许多检测遗传学纯度的方法加以鉴定。人们曾经习惯用“纯种”称呼近交系。

到1980年为止，近交系小鼠己有250个品系。小鼠、大鼠等一些实验动物的近交系的育成，大大促进了生物医学实验研究的发展。尤其对于肿瘤研究的进展起到更重要的作用。

2.突变品系  在育种过程中，由于单个基因的突变，或将某个基因导入，或通过多次回交“留种”，而建立一个同类突变品系，此类个体中有具同样遗传缺陷或病态。如侏儒、无毛、肥胖症、肌萎缩、白内障、视网膜退化等等。现己培育成的自然具有某些疾病的夹变品系有：贫血鼠、肿瘤鼠、白血病鼠、糖尿病鼠。高血压鼠和裸鼠（无胸腺无毛，右图）等等。这些品系的动物大量应用于相应疾病的防治研究，具有重大的价值。

3.杂交一代  由两个近交系杂交产生的子一代称为杂交一代。它既有近交系动物的特点，又获得了杂交优势。杂交一代具有旺盛的生命力、繁殖率高、生长快、体质健壮、抗病力强等优点。它与近交系动物有同样的实验效果。杂交一代又称为系统杂交性动物。

4.封闭群  在同一血缘品系内，不以近交方式，而进行随机交配繁衍，经五年以上育成的相对维持同一血缘关系的种群。我国己大量繁殖封闭群新西兰白免和封闭群青紫蓝兔。可用于教学科研实验。

5.非纯系  即一般任意交配繁殖的杂种动物。杂种动物具有旺盛的生命力，适应性强，繁殖率高，生长快，易于饲养管理。个体差异大，反应性不规则，实验结果的重复性差。但其中包含有最敏感的与最不敏感的两种极端的个体，适用于筛选性实验。杂种动物比较经济，在教学实验中最常用。